Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms