Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL33A6NCF5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms