Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM149AA5PLN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM149AA5PLN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms