Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC162PA2VCL2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms