Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIPSLA2A3N6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms