Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 YBX1P7-201ENST00000436766 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P24-201ENST00000476029 1046 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AP006437.2-201ENST00000528000 345 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PAX3-202ENST00000336840 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC00664-201ENST00000596203 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 SUPT3H-201ENST00000371458 728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 PRSS3-204ENST00000429677 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIRT1Q96EB6 AC137936.2-201ENST00000636329 620 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms