Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 RNF17-202ENST00000255325 2134 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCAP28676 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 APOL3-201ENST00000349314 2117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 SALL4P1-201ENST00000510352 1860 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 GRM3-203ENST00000439827 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 USP3-213ENST00000559711 1693 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 MSR1-205ENST00000445506 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 OR4X1-201ENST00000320048 918 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCAP28676 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCAP28676 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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