Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SLC25A14-213ENST00000543953 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RPL17P34-201ENST00000394133 555 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FAM170A-206ENST00000613773 1374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TIRAP-201ENST00000392678 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CST13P-202ENST00000400563 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC005996.2-201ENST00000465549 564 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LMO3-228ENST00000541846 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC093323.3-201ENST00000632627 949 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC012184.3-201ENST00000562077 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL121574.1-201ENST00000415890 419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms