Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ARL16-207ENST00000573392 869 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01828-205ENST00000594329 863 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC079882.1-201ENST00000609433 375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 S100A4-204ENST00000368716 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPL7AP11-201ENST00000486538 799 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MAJIN-204ENST00000530444 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC127496.2-201ENST00000576859 368 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 CIDECP-205ENST00000433871 770 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 AC099796.2-201ENST00000444140 108 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRXP46100 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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