Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms