Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL355357.1-203ENST00000402154 639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P62-201ENST00000559372 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 JAML-201ENST00000292067 1959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SGCZ-202ENST00000421524 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 GNGT2-204ENST00000511277 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 CHRDL2-201ENST00000263671 1712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 PRAMEF20-202ENST00000602960 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1SQ13698 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms