Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MUC4-203ENST00000346145 3982 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BORCS7-201ENST00000339834 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 UGT1A9-201ENST00000354728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYP4F62P-202ENST00000439137 2144 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MPP3-202ENST00000398393 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 EXTL3-AS1-201ENST00000501224 3691 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BTN2A2-206ENST00000469230 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC008543.5-201ENST00000589227 2515 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HKDC1-201ENST00000354624 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PCAT29-201ENST00000558411 2121 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 TGM5-205ENST00000610827 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CPNE8-203ENST00000538596 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SPRYD3-201ENST00000301463 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 INPP5K-203ENST00000406424 3194 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 PLCD4-206ENST00000450993 3232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LSAMPQ13449 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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