Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC068669.1-201ENST00000623793 2228 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HMGB1P1B2RPK0 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms