Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MIR4761-201ENST00000585066 82 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL158847.1-201ENST00000431955 808 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL590683.1-201ENST00000439059 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL133464.1-205ENST00000634595 1535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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