Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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