Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms