Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GPR21-201ENST00000373642 1170 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC01621-201ENST00000438797 481 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL450326.1-201ENST00000442526 760 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 USP41-202ENST00000454608 1077 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL359220.1-201ENST00000554086 781 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MT3-206ENST00000570176 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AP002478.2-201ENST00000584060 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC013564.1-201ENST00000612806 707 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FP236383.2-201ENST00000625598 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FP236383.3-201ENST00000627981 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FP671120.3-201ENST00000631211 923 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KNSTRN-203ENST00000448395 1464 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SAMMSON-221ENST00000641715 1546 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CRYZL1-204ENST00000381554 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C10orf99-201ENST00000372126 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CNN2P4-201ENST00000396461 904 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PPP1R2P1-209ENST00000420261 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 C12orf71-201ENST00000429849 957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ZFYVE9P2-201ENST00000447321 604 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC245595.1-202ENST00000457390 425 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC025682.1-204ENST00000580045 733 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RN7SL491P-201ENST00000584748 269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 EEF1GP4-201ENST00000467631 1307 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 TRAV2-201ENST00000390424 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 KRT8P40-201ENST00000392131 563 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 PHBP5-201ENST00000449310 768 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 ARL17B-202ENST00000450673 743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 MT1HL1-201ENST00000464121 316 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms