Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E2F1Q01094 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms