Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms