Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A4Q9Y6R1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms