Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms