Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX8Q9Y5X2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms