Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPRBQ9Y5M8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms