Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FARP1Q9Y4F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms