Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KIF3AQ9Y496 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3AQ9Y496 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms