Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms