Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITM2BQ9Y287 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms