Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3IP3Q9Y228 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3IP3Q9Y228 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms