Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML2Q9UQR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms