Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVW-1Q9UQF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVW-1Q9UQF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms