Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF9BQ9UPX0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF9BQ9UPX0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms