Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG5Q9UPR3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms