Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCAF8Q9UPN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCAF8Q9UPN6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SCAF8Q9UPN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms