Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD1Q9UP38 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD1Q9UP38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD1Q9UP38 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms