Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms