Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML1Q9UN30 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms