Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHTF1Q9UMS5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF1Q9UMS5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms