Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED23Q9ULK4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms