Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms