Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCTN4Q9UJW0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN4Q9UJW0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms