Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD1Q9UIS9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms