Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC5Q9UII4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms