Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP4Q9UGJ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms