Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALPQ9UBC7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALPQ9UBC7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms