Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD2Q9UBB5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.4 ms