Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRBP1Q9P2E9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RRBP1Q9P2E9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms