Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN3Q9P232 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNTN3Q9P232 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms