Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL20A1Q9P218 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL20A1Q9P218 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COL20A1Q9P218 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL20A1Q9P218 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL20A1Q9P218 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL20A1Q9P218 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL20A1Q9P218 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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