Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHRNQ9P202 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHRNQ9P202 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms