Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNRD1Q9P1U0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms